El Proyecto responde a una creciente preocupación sobre la necesidad de adoptar medidas adecuadas para la protección del medio ambiente del Río de la Plata y su Frente Marítimo y para asegurar el desarrollo sustentable de sus usos y recursos.

El punto de partida se encuentra en la Primera Reunión Binacional sobre la Prevención de la Contaminación en el Frente Marítimo convocada por la Comisión Técnica Mixta del Frente Marítimo (CTMFM) en 1993. Una de las conclusiones del encuentro fue que la integridad del entorno de esa zona marítima, dependía de un conjunto de procesos que se desarrollaban en un espacio mucho más amplio.

En la Resolución Conjunta de la Comisión Administradora del Río de la Plata (CARP) y la Comisión Técnica Mixta del Frente Marítimo firmada el 7 de abril de 1994, se acuerda que ambos organismos binacionales cooperarían en todo lo referente a la elaboración y presentación de una propuesta de Proyecto.

En mayo de 1997 las dos Comisiones presentaron al PNUD, para su elevación al Fondo para el Medio Ambiente Mundial, una solicitud de fondos para el desarrollo de Proyectos de Bloque “B”. La respuesta fue favorable y esos recursos no reembolsables fueron utilizados para la elaboración de una propuesta de Proyecto. El documento correspondiente fue elevado al Fondo en noviembre de 1998, siendo aprobado por el mismo poco después. Por último, el Documento de Proyecto a escala completa fue suscrito el 22 de noviembre de1999, dándose inmediatamente inicio a la ejecución del mismo.